診所污水其綜合水質類似于生活污水，但比生活污水所含化學成分更為復雜，因其人均排水量大于生活污水排水量，所以其CODcr、BOD5。指標一般低于城市生活污水，其細菌與糞大腸桿菌含量與城市生活污水相近，但由于診所消毒劑用量多，其污水成分中還含有重金屬、有機溶劑、消毒劑等物質，在對診所污水治理時必須予以充分的重視。